ใน ปี พ.ศ. 2549 คณะวิศวกรรมศาสตร์ ถูกจัดตั้งขึ้นเป็นหน่วยงานหนึ่งสังกัด “มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีราชมงคลอีสาน” ตามกฎกระทรวง จัดตั้งส่วนราชการในมหาวิทยาลัยเทคโนโลยีราชมงคลอีสาน กระทรวงศึกษาธิการ พ.ศ.2549 โดยมี ผู้ช่วยศาสตราจารย์วศิษฐ ธีระเจตกูล เป็นคณบดีคณะวิศวกรรมศาสตร์ (สมัยที่ 1 ระหว่าง ปี พ.ศ. 2550 – 2554) และผู้ช่วยศาสตราจารย์วันชัย แสนคำวงษ์ ดำรงตำแหน่งคณบดีในช่วง สมัยที่ 2 ระหว่าง ปี พ.ศ. 2554 – 2558 สมัยที่ 3 อาจารย์ปริญ นาชัยสิทธิ์ (วันที่ 9 ก.พ.2558 – 8 ก.พ.2566) ดำรงตำแหน่ง 2 วาระ และได้รับการแต่งตั้งให้ดำรงตำแหน่งรองอธิการบดีฝ่ายยุทธศาสตร์นโยบายและแผน มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีราชมงคลอีสาน เมื่อวันที่ 5 ก.ค. 2564 จึงได้แต่งตั้ง อาจารย์ ดร.ศุภฤกษ์ ชามงคลประดิษฐ์ รักษาราชการแทนคณบดีคณะวิศวกรรมศาสตร์ (วันที่ 5 ก.ค.2564 – 28 ธ.ค. 2564) สมัยที่ 4 อาจารย์ ดร.ศุภฤกษ์ ชามงคลประดิษฐ์ (วันที่ 29 ต.ค. 2564 – ปัจจุบัน)
ปัจจุบัน คณะวิศวกรรมศาสตร์ได้ดำเนินการจัดการศึกษา ระดับปริญญาตรี ปริญญาโทด้านวิศวกรรมศาสตร์และวิทยาศาสตร์ โดยมีภารกิจหลัก 4 ภารกิจ คือ การจัดการเรียนการสอน การทำวิจัย การให้บริการทางวิชาการ และ การทำนุบำรุงศิลปวัฒนธรรม เพื่อสร้างคุณค่าที่ดีแก่สังคมและประเทศชาติ ภายใต้วิสัยทัศน์(Vision) “เป็นผู้นำในการผลิตบัณฑิตปฏิบัติ มี ฝีมือ ระเบียบ วินัย น้ำใจ เป็นเลิศด้านวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี สร้างนวัตกรรมที่มีคุณค่าแก่สังคม สู่ภูมิภาคอาเซียน” อัตลักษณ์ของบัณฑิตคณะวิศวกรรมศาสตร์ (Graduates Appearance) “บัณฑิตนักปฏิบัติ”อัตลักษณ์ของคณะวิศวกรรมศาสตร์ (Appearance of Faculty) “บัณฑิตมีทักษะพร้อมปฏิบัติงาน” และเอกลักษณ์ของคณะวิศวกรรมศาสตร์ (Identity of Faculty) “เทคโนโลยีเป็นฐานแห่งการสร้างอาชีพเฉพาะทาง” สอดคล้องกับปรัชญาการจัดการศึกษาของมหาวิทยาลัยที่ว่า “สร้างคนสู่งาน เชี่ยวชาญเทคโนโลยี”
หลักสูตร หลักสูตรวิศวกรรมศาสตรบัณฑิต (วศ.บ.) จำนวน 10 หลักสูตร ได้แก่ วิศวกรรมโยธา วิศวกรรมไฟฟ้า วิศวกรรมอิเล็กทรอนิกส์และโทรคมนาคม วิศวกรรมคอมพิวเตอร์ วิศวกรรมเมคคาทรอนิกส์ วิศวกรรมเครื่องกล วิศวกรรมเครื่องจักรกลเกษตร วิศวกรรมหลังการเก็บเกี่ยวและแปรสภาพ วิศวกรรมอุตสาหการ และวิศวกรรมโลหการ และหลักสูตรวิทยาศาสตรบัณฑิต(วทบ.) 1 หลักสูตร ได้แก่ เคมี ระดับปริญญาโท 2 หลักสูตรหลักสูตรวิศวกรรมศาสตรมหาบัณฑิต(วศ.ม.) จำนวน 2 หลักสูตร ได้แก่ วิศวกรรมเครื่องกล วิศวกรรมโยธา
จากสถาบันการศึกษา ที่จัดการเรียนการสอนในระดับอาชีวศึกษา สายช่างอุตสาหกรรม มากว่า 50 ปีที่ผ่านมา ภายใต้คำขวัญ “ฝีมือ ระเบียบวินัย น้ำใจ”ชื่อเสียงของ เทคนิคไทย-เยอรมัน ขอนแก่น เป็นที่ประจักษ์ ในด้านฝีมือ ความรู้ความสามารถ ศิษย์ของเรา เป็นที่ยอมรับของสถานประกอบการทั้งในภาครัฐและเอกชน เสมอมา คณะวิศวกรรมศาสตร์ จึงมุ่งมั่นผลิตบัณฑิตนักปฏิบัติ ให้ความรู้ ความสามารถ รวมทั้ง ฝีมือ ระเบียบวินัย น้ำใจ เพื่อสืบสาน ตำนานช่างแห่งอีสาน ที่พวกเราภาคภูมิใจสืบต่อไป ภายใต้กับปรัชญาการจัดการศึกษาที่ว่า “เราจะพัฒนากำลังคนให้มีทักษะวิชาชีพและเทคโนโลยี เพื่อพัฒนาสังคมและเศรษฐกิจของประเทศ”